Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms