Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms