Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc5lQ9D898 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms