Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af1Q9D883 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1Q9D883 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms