Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timm50Q9D880 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Timm50Q9D880 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm50Q9D880 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms