Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns2Q9D7J7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms