Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfsf13Q9D777 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfsf13Q9D777 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms