Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nsmce1Q9D720 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nsmce1Q9D720 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms