Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc3Q9D6Y1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc3Q9D6Y1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms