Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Borcs6Q9D6W8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Borcs6Q9D6W8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms