Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ShpkQ9D5J6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ShpkQ9D5J6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ShpkQ9D5J6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ShpkQ9D5J6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ShpkQ9D5J6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ShpkQ9D5J6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ShpkQ9D5J6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ShpkQ9D5J6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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