Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf6Q9D4J7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf6Q9D4J7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms