Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus10Q9D3U0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms