Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lamp5Q9D387 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lamp5Q9D387 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms