Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lmbr1lQ9D1E5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbr1lQ9D1E5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms