Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hddc3Q9D114 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Hddc3Q9D114 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hddc3Q9D114 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms