Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift27Q9D0P8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms