Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
3110001I22RikQ9CZ70 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
3110001I22RikQ9CZ70 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms