Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gje1Q9CX92 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gje1Q9CX92 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms