Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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