Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms