Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkrip1Q9CWV6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkrip1Q9CWV6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms