Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tdrd12Q9CWU0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms