Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smyd3Q9CWR2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd3Q9CWR2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms