Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NubplQ9CWD8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NubplQ9CWD8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms