Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms