Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rhobtb3Q9CTN4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms