Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NmbQ9CR53 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NmbQ9CR53 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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