Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd5Q9CQP3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd5Q9CQP3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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