Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9CQF4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9CQF4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQF4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms