Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms