Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms