Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg3Q9CPX6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms