Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519G04RikQ9CPT7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519G04RikQ9CPT7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms