Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms