Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim26Q99PN3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim26Q99PN3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms