Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl43Q99N89 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms