Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf17Q99MV7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rnf17Q99MV7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms