Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Tdrd1Q99MV1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tdrd1Q99MV1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tdrd1Q99MV1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Tdrd1Q99MV1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tdrd1Q99MV1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tdrd1Q99MV1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tdrd1Q99MV1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tdrd1Q99MV1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tdrd1Q99MV1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tdrd1Q99MV1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Tdrd1Q99MV1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Tdrd1Q99MV1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Tdrd1Q99MV1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Tdrd1Q99MV1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Tdrd1Q99MV1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Tdrd1Q99MV1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Tdrd1Q99MV1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Tdrd1Q99MV1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Tdrd1Q99MV1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Tdrd1Q99MV1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tdrd1Q99MV1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms