Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PccbQ99MN9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PccbQ99MN9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.4 ms