Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KarsQ99MN1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms