Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SncaipQ99ME3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SncaipQ99ME3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms