Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprtQ99M80 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprtQ99M80 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprtQ99M80 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprtQ99M80 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprtQ99M80 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprtQ99M80 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprtQ99M80 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprtQ99M80 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprtQ99M80 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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