Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp16Q99LG0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms