Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Reep3Q99KK1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms