Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Emc3Q99KI3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms