Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hps4Q99KG7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hps4Q99KG7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms