Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ufsp2Q99K23 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ufsp2Q99K23 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms