Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TrabdQ99JY4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms