Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec3Q99J72 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms